该剧以“抗疫”期间各行各业真实的人物、故事为基础，由《生命的拐点》《摆渡人》《同行》《救护者》《搜索24小时》《火神山》《方舱》《我叫大连》《口罩》《武汉人》十个单元故事组成，讲述了中国军民在抗击新冠肺炎疫情中的人和事：他们中有义无反顾为人民建起一座白衣长城的医护工作者；有万里赴戎机、八方支援的各地医疗队员；有秉承革命军人优良传统、闻令而动、誓死不退的军医；有平凡又伟大的外卖小哥和专车志愿者；有自救互救、守望相助的普通市民；有积极投身火神山医院的建设者；有在联防联控工作中扎根基层的疾控、社区、公安人员；有误打误撞留在武汉成为志愿者投身抗疫事业的年轻人；有克服种种困难转产口罩、为“复产复工”做出贡献的人们。这些普通人构成了全国上下、各行各业抗击疫情的主力军，为抗击疫情做出不可磨灭的贡献。

　　新城仁和医院，护士张淑梅被质疑用错药导致病人死亡被迫离开岗位，4岁女儿被人贩拐，张淑梅精神恍惚两年后被车祸夺去生命。美籍华裔外科专家庄恕为追查30年前母亲张淑梅的事故真相找寻走失的妹妹来到新城仁和医院。当年死者的女儿陆晨曦士师从傅博文成长为胸外科主治医生，却因反感利益为先屡次得罪胸外科主任扬帆被调至急诊。是庄恕屡次把技能过硬的陆晨曦重新带回胸外手术台。朝夕相处中，庄恕的医术让陆晨曦惊叹，对患者的周到考虑也让陆晨曦反思，二人渐生情愫，最终，庄恕找回了妹妹，也在陆晨曦的协助下还原了当年母亲当年事故的真相。

　　小夫妻肖路与方一诺结婚多年，喜迎贵子。生产当日，产房外兵慌马乱的肖路却意外缺席。随着孩子的出生，这对新手爸妈也开始迎接身份转换后的各种挑战。随着双方父母的介入，一系列家庭矛盾频发，导致夫妻关系走向拐点与暗礁，两人最终分道扬镳。多年后，已各自重组家庭的他们生活归于平静，女儿禾禾却在此时被发现身患白血病。大夫从医学角度出发，建议他们再生一个孩子来拯救生命。于是，这场救女引发的风暴将几个家庭都推向人性的拷问和艰难的抉择。

　　该剧讲述了一起发生在南方四线小城海舟市的连环凶案，在真相尘封了十七年之后，与这宗悬案有着千丝万缕的联系的人们，在各自不可告人的秘密中，一起等待真相浮出水面……

1937年“卢沟桥事变”爆发后，在战云密布的上海，原国民政府国防部中校参谋、中共地下党员欧阳剑平（女），前来与中共地下党上级冯先生接头。两人刚见面，就遭遇了杀手的埋伏，冯先生险些遇害。欧阳剑平勇敢救出了冯先生。冯先生此番来上海，交给了欧阳剑平一项重要任务，就是召集几个在国外的军校同学，在上海组织一只秘密的特工组，与日特间谍机关展开斗争。几天后，欧阳剑平在码头迎接来自德国慕尼黑通讯学院访问学者、密码专家高寒（女）。她机智地在船上除掉了秘密盯梢的日本特务，随欧阳剑平安全回到了法租界的驻地。她们两家是世交，当年“九一八”时，欧阳剑平的父亲曾因为救护高寒的父亲而牺牲。此时，曾任国民政府驻东京领事馆武官的马云飞正在回上海的火车上。他是个英俊潇洒的男人，在火车上邂逅了一个美貌的女子。很快，他就识破了这个女人就是来上海日军宪兵司令部就任特高课课长的酒井美惠子。她是大特务土肥原贤二的高足，虽为女流，却足智多谋。他们的较量就此拉开了序幕。翌日黎明，马云飞巧妙地摆脱了酒井，与欧阳剑平等人会合了。可是，马云飞与高寒是过去的情人，如今相见，难免有些尴尬。当晚，他们三人去“百乐门”等候小组另一成员——来自英国考文垂机械厂工程师、爆破专家李智博。却意外地与酒井再次遭遇，虽然是歌舞升平，但其中闪动着刀光剑影。女人的手枪直抵马云飞的脑袋！

《五号特工组2》是继《五号特工组》之后的又一部革命动作戏，沿袭了《五号特工组》一贯的动作性和悬疑推理性风格，在大众喜闻乐见的前提下，雅俗共赏，充分体现了文学艺术性，同时，该剧也包含着浓郁的人情味，揭示了战争与人性这样深刻的主题。马云飞和高寒婚礼的当天，来了一个不速之客——“五号特工组”的老朋友老于，恳请他们再次出山，执行一项别人无法完成的任务：追查盗窃美国核武器资料的双料间谍吉川猛夫。为此，高寒做了落跑新娘，跟随欧阳剑平和李智博赶赴云南接受任务，马云飞和何坚也被迫出山，于是“五号特工组”五位成员：语言专家欧阳剑平、爆破专家李智博、特工马云飞、密码专家高寒、“神偷”何坚再次集结上了前线。同时，日本方面派出了他们的杀手锏，酒井朝香——她是酒井美惠子的亲妹妹，一个手腕更加毒辣凶狠的高级女间谍。