陈浩南（郑伊健饰）、山鸡（陈小春饰）、巢皮等人从少年时代起就是好友。他们无心读书，一心向往江湖生活。终于有江湖人士大佬B收纳为徒，开始闯荡江湖。浩南在一次黑帮仇杀中大展拳脚，杀死了黑道大哥巴闭，因此与另一头目靓坤(吴镇宇饰)结下深仇。靓坤设法加害浩南，令浩南兄弟巢皮惨死，而浩南误服药物与山鸡女友发生关系，兄弟间开始积怨。浩南心灰意冷，打算收手，怎料大佬B遭全家灭门，自己经营的店铺被烧毁，靓坤的步步相逼令浩南忍无可忍。

　　本来是重案组沙展的朱华标（刘青云饰）因殴打上司被处分调往冲锋队。成为麦兜（张达明饰）、Apple（李绮红饰）、大丹、饭焦（陈小春饰）几人的上司，但朱标华却与饭焦常常发生矛盾。
　　此时，重犯教授与小鸟成功从狱中逃脱，更想在闹市中枪杀译名国际刑警，标华不管上司及同事的反对而奋力追捕，就算最后他们一组人成功将教授抓获。一天他们在巡逻时，标华收到消息这群罪犯要到国际刑警的总部偷取九千万的赃款，标华正欲前往，但他们本身就有任务在身，饭焦便极力反对标华的行动……

　　缉毒队队员泰桦（陈小春饰）、老米（谢天华饰）、阿峰（林晓峰饰）、阿棠（朱永棠饰）是感情要好四兄弟，多年前四人参与逮捕跨国毒枭老爹（秦沛饰），行动之前上级卢sir要求所有人上交行动电话，以便防止窃听。然而老爹收买了黑警，四人中了老爹圈套，阿峰不幸遇难，卢sir也在行动中牺牲。阿棠就彻底从警队消失，老米与泰桦之间的关系变得紧张起来。
　　老爹怀疑左右手老三的身份，老三在老爹身边多年，为了自保时常向卢sir提供了情报。老米与泰桦合力抓捕狗牙，老三开枪将其打死，并自称卧底说当年被老爹贿赂的不只周sir……。
　　泰桦、老米为了给兄弟们报仇，展开了搏斗。

本片讲述了ICAC廉政公署在历史上首次绝密行动档案，面对黑白两道横行，纸醉金迷的黑金年代，以双雄争霸轰动全港的四大家族案和洗黑钱案，环环相扣局中局，黑金风暴牵涉人员从基层到督察重要官员无一幸免，战火甚至延续到廉政公署内部…