柯南在街头目睹一名正打电话的警察在雨中被射杀，忙将凶手追踪，但凶手逃脱。死者闭眼一刻紧抓左胸，似乎有所暗示。事后柯南从目暮警官口中了解到紧抓左胸是暗示那里有警察手册。不久又有警察手拿警察手册被人射杀于地下车库。对于这两起案件，目暮警官等人一反常态不愿向毛利小五郎及柯南透露太多信息。毛利不甘心进一步追问，白鸟警官只答一句“Neednottoknow”。该话是警察之间所用的密语，意味这两起杀人事件与警察内部人士有关。
　　柯南、小兰等人参加白鸟妹妹的婚宴，电突然间停掉，那刻小兰正与女警佐藤在洗手间。小兰拿起身边的手电筒欲照明时，一颗子弹射进佐藤身体，小兰吓昏过去。次日小兰醒来，却因怪责自己害佐藤挨枪失去记忆。目暮见事态越来越严重，将秘密说出，原来死去的两名警察正与佐藤一起重查一桩有关医生仁野自杀的案件，该案涉及到警察局长的公子。将局长公子假定为嫌疑人之一时，柯南亦想到佐藤被射杀后宴会上少掉的两个人。

　　故事发生在东京八丈岛近海，这里建成了一座连接了全球各地警方监控摄像的海洋设施“太平洋浮标”。在这座设施正式启动之前，为了与欧洲刑警组织管辖的范围联网，世界各国的IT工程师来到现场。而与此同时，一项应用了人脸识别系统的“新技术”的测试也在进行中……
　　另一方面，柯南和少年侦探团在园子的招待下来到八丈岛赏鲸。此时，柯南接到来自冲矢昂（赤井秀一）的电话，被告知欧洲刑警组织的成员在德国遭到琴酒的杀害。为调查真相，柯南偷偷混进了前往“太平洋浮标”进行警备工作的黑田兵卫等警视厅人员乘坐的警备艇中，进入设施内部。之后，在为系统启动而稳步展开准备工作的设施内，发生了案件——一名女性工程遭到黑衣组织的绑架，而她手中装有某些情报的U盘也落到了黑衣组织的手里。
　　海中传来令人毛骨悚然的螺旋桨声。而此时身在八丈岛的灰原哀身边，也正有黑影在悄悄靠近……

　　知名舞台剧女演员牧树里这日收到怪盗基德的预告信：在26个字母的盘旋飞舞中，他来拜领无价的“命运的宝石”。毛利小五郎受到牧树里委托将信件分析，认为基德将在演出最后一晚前来盗取宝石，当晚他及柯南、小兰等人来到剧场，那里早有诸多警察守候。
　　令柯南吃惊的是，基德竟扮成工藤新一出现在众人面前，但他及众人方向不同的紧张过后，宝石并没被盗，柯南醒悟字母预告信与航班相关。而柯南、小兰、牧树里及其同事搭乘的前往北海道的飞机上，尚有一起杀人计划正被精心设计。

　　漆黑的夜晚，一名间谍悄然潜入日本警方某机构，盗走了记载着各国谍报机构重要数据的绝密文件的绝密数据。日本警方和FBI探员赤井秀一（池田秀一配音）旋即与间谍展开追逐。最后，逃亡者的车辆坠落悬崖。第二天，柯南（高山南配音）和伙伴们来到东都水族馆观光，结果发现一名受伤的美丽女子（天海佑希配音）。该女子处于失忆状态，身上的手机也破损无法使用。柯南等人答应要帮她恢复记忆，当他们七嘴八舌之际，藏在暗处的黑衣组织成员贝尔摩德（小山茉美配音）冷冷地注视着这一切。在相处过程中，女子非凡的身手和奇怪的言行举止让灰原哀（林原惠美配音）对其真实身份产生怀疑。
　　刚刚还一派祥和的水族馆，沉浸在快乐之中的人们，根本会想到随着那名神秘女子技艺的恢复，自己马上就要被卷入黑暗组织的杀戮和混乱之中……

　　东京峰会召开在即，为了确保会议顺利进行，日本警方出动约两万名警力对位于东京湾的超大设施“海洋边缘”进行安保工作。可就在严密的防控下，此地已然发生了爆炸案。令柯南（高山南配音）等人始料未及的是，现场居然留下了对毛利小五郎（小山力也配音）极其不利的证据。在此之后，小五郎遭到逮捕。柯南则发现安室透曾出现在爆炸现场，并且负了伤。为了还毛利叔叔的清白，柯南和阿笠博士以及少年侦探团的小伙伴们联合起来勘察现场，搜集证据。随着调查的深入，柯南发现这起爆炸案隐藏着包括恐怖分子、公安在内多方的复杂关系，而真相更令所有人瞠目结舌……
　　本片是“名侦探柯南系列”第22部动画剧场版，票房总收入超过90亿日元。

　　“名侦探柯南系列”第23部动画剧场版，票房和口碑也屡破纪录。作为平成年代最后一部柯南电影，首次将案件发生地设立在海外，基德时隔四年后再度回归，与柯南合体展开行动。
　　故事围绕着19世纪末与海盗船一同沉入海底、世界上最大的蓝宝石“绀青之拳”展开。

　2009年11月，东安火车站，邓草草带儿子轩轩上车时遇到人犯子，轩轩被一位老太太拐走，邓草草回去追赶，她无力和对方争执，眼见轩轩离开而晕倒。刚下火车的龚剑原是部队特种兵，看到轩轩上车后追赶上去，龚剑在途中接到妻子周丽君电话，她要飞往纽约，还让他在离婚协议书上签字，龚剑听完后傻傻地站在原地。邓草草的世界随着孩子的走失而崩溃，回家后被老公关皓大骂，她离了婚，怀着对孩子的愧疚和对自己的不原谅独自生活。龚剑赶往机场追赶周丽君，周丽君听到广播后和他相见，她打掉了肚里的孩子，龚剑很生气，周丽群诉说十年的委屈，龚剑转业就是想和她重新开始，但周丽君坚持离婚。邓草草四处寻子，见到别人孩子就想起失散的轩轩，地上的寻子启示引起她的注意，弄丢资料被客户投诉，闺密周丽雯帮她处理。周丽雯和邓草草聊起离婚之事，邓草草的变故让她很惊讶。龚剑转业后去北翱集团担任执行总裁。周丽雯来到邓草草的住所，家里没有暖气，周丽雯看出她手头有点儿紧儿，邓草草当快递员也是为了寻找孩子。周丽雯带邓草草去喝洒，她看到桌子上寻子启示的广告，周丽雯劝邓草草再找一个男人，邓草草不想去孙南威的律师事务所，周丽雯还打算给邓草草相亲。邓草草酒后晕过去，等她清醒时起身离开，险些被色狼调戏。

　　邓草草相亲途中被车溅了一身泥，高底鞋也断了，见到龚剑后聊起迟到原因，龚剑承认开车的人是他，邓草草生气地指责他，龚剑答应去商场买新的赔给她。龚剑被父母逼婚，他去相亲也是迫于无奈，买完衣服后龚剑提出请邓草草吃饭，她想去鱿鱼火锅店，龚剑去了一品羊。邓草草吃饭时借机去卫生间离开，之后删除了龚剑的手机号。龚剑知道助手乔小芮不错，但他不能确定那种感觉是否是爱情，龚剑心里又想起邓草草换衣服的画面。邓草草在周丽雯的介绍下去了律师事务所工作，孙南威在那里说话算数。邓草草拨通龚剑的电话，她对上次的不辞而别表示歉意，还要请他吃饭，龚剑很意外。龚剑应邀去吃饭，饭后他让邓草草打车回家，邓草草上车后拿酒请他喝，车外下起大雪，龚剑放起音乐，两人热吻。

日月魔教纵横四海，势力日盛，欲一统江湖。五岳剑派组成正义联盟，与魔教抗衡。任我行闭关专注神功闭关修炼，东方不败为了日月神教教主之位谋划了这场让五岳剑派进攻日月神教，但是因为任我行闭关修炼，不想和五岳剑派正面交锋，东方不败不甘心，就准备利用任我行的妻子和女儿。当东方不败到任我行闭关的地方报告五岳剑派的情况，任我行决定不正面交锋，但是东方不败不甘心，就派人把任盈盈抓走；　　然后任我行的妻子以为是五岳剑派抓了盈盈，独自一人去找五岳剑派讨要女儿，此时五岳剑派正在黑木崖下，正在想如何登上黑木崖，任夫人以为五岳剑派抓走就和嵩山派掌门左冷禅被擒获。傍晚，华山派岳不群的夫人看不惯左冷禅的做法，就把任夫人放了，并告诉他们并没有上黑木崖，所以没有抓走她的女儿，当任夫人走后，就被自己师兄发现了，但是并没有阻拦，突然大家都醒了一起都去寻找任夫人。任夫人回到黑木崖告诉东方不败说并没看见盈盈，但是东方不败为了自己的计划，直接就杀死了任夫人