刑事情报高级督察卓凯（苗侨伟饰）现身泰国曼谷，在当地获得重要情报：九指强与泰国倪坤进行毒品交易。追查之后发现吉运帮黑吃黑将倪坤杀死与九指强进行交易。为寻找吉运帮犯罪证据卓凯与卧底潜入社团窝点后被PakKey得力手下乐少锋（周柏豪饰）发现行动，和他们交起手来。逃脱之后卓凯一行人准备离开泰国返回香港时发生一场大爆炸，除了卓凯之外的所有卧底葬身火海。伤心欲绝的卓凯返回香港后面临停职，变得一蹶不振。与此同时香港最大的社团长兴发生内斗，长兴新继任的龙头魏德信（陈豪饰）以雷厉风行手段剿灭社团的高级头目，其中包括覃欢喜（许绍雄饰）。然而覃欢喜是长期潜伏在长兴的卧底，面临此番处境，他曾想过向Handler求助调回警察队伍，但妻子突然出事惨死在社团人士手中，令覃欢喜彻底沦入黑道。

传奇卧底爆seed归来，发现世界天翻地覆。昔日如师如友的搭档卓凯疑似变节，空降上司韦作荣作风强硬。敌友难分，关系错综，一场关乎每个人安危的对决，正愈演愈烈！

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出身香港社会最底层的丁小嘉（佘诗曼饰）在考上警察后，又以卧底的身份重回鱼龙混杂的砵兰街，替CID督查康道行（欧瑞伟饰）搜集情报。谁知在追查三合会头目游达富的犯罪事实过程中，道行意外遇害身亡。他在临死前为防止手下卧底人员身份暴露，而删除了包括小嘉在内等五名卧底的纪录。在此之后，道行的同袍刑事情报科总督察卓凯（苗侨伟饰）联系到小嘉，希望其能协助找到其他四名卧底，并掌握外围赌博集团的犯罪证据。在此之后，小嘉和赌博集团的得力干将薛家强（林峯饰）发生交集，更由此陷入警方与犯罪团伙、黑帮组织之间的连番对决和火并之中，由此上演了一段令人拍案叫绝的卧底传奇……

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WhenthreeEmiratisoldiersareambushedinahostileterritory,theircommanderleadsadaringmissiontorescuethemaaa