凯撒（安迪·瑟金斯饰）和他的领导的猿族为求生存与人类交战，在坚守家园的同时也在寻找其它宜居的地方。残暴的“上校”（伍迪·哈里森饰）领导的军队入侵了凯撒的基地，并杀害了他妻儿在内的众多猿族子民。这激发了凯撒内心中黑暗的一面，心中燃起复仇的烈火。凯撒让幸存的猿族启程去他儿子生前发现的避风港，而自己决意去找“上校”报仇。凯撒不久后发现“上校”不仅对猿族赶尽杀绝，同时也在与另一拨人在交战。邪恶上校袭击并囚禁了逃生的猿，迫使他们为自己的根据地筑防。时间紧迫，另一支人类军队就要兵临城下，与上校的军队交战；并很有可能危及猿族子民。为了解救自己的子民，凯撒此时强忍着复仇的怒火，策划并成功实施了逃生计划 。

　　故事描述美国总统乘坐的空军一号飞机在著名的百慕大三角地区坠毁，一支海军救援队赶到现场实施救援。他们发现人类的出现唤醒了一只邪恶的大海怪，整个美国东海岸乃至全世界都可能因此遭殃...