比利·巴特森和其他孩子们虽然获得了超凡的神力和成人的外表，但仍处在青春期的他们还在学习如何平衡内心与外在的不同。但是当阿特拉斯的女儿——复仇三女神来到地球，寻找很久以前被偷走的神力时，比利·巴特森和家人们将为了守护他们的超能力、生命以及整个世界的命运而展开一场激战。

影片根据迪士尼乐园游玩项目“丛林巡航”改编，故事发生在野心家与探险家并起的上世纪初，勇敢无畏的女科学家莉莉·霍顿博士（艾米莉·布朗特 饰） 来到亚马逊寻找有治愈魔力的神树，并雇佣了玩世不恭的弗兰克船长（道恩·强森 饰）开启探险。在这史诗般的冒险途中，看似不对盘的两人在茂密雨林中遭遇了无数的危险和超自然力量。但随着这棵神奇古树的秘密逐渐揭开，莉莉和弗兰克的命运，乃至整个人类的命运都岌岌可危。